Flore intestinale et espèces de Lactobacillus

Effet des bactéries sur notre flore intestinale

Les probiotiques sont des préparations contenant des bactéries intestinales vivantes ou lyophilisées.
La flore intestinale est très diverse, ce qui signifie qu’un intestin sain contient des centaines d’espèces bactériennes. Les lactobacilles sont souvent prescrits en cas de troubles intestinaux et après une cure d’antibiotiques.

Que sont les probiotiques ?

La définition scientifique officielle des probiotiques est la suivante : « Un probiotique est une préparation ou un produit contenant des micro-organismes vivants, bien définis, en quantité suffisante, qui modifie la microflore d’un organe particulier de l’hôte et exerce ainsi un effet bénéfique sur la santé de l’hôte. » Cette définition est trop limitée, car il apparaît que les bénéfices des probiotiques résident principalement dans la stimulation d’une réponse immunitaire favorable – et non dans un organe spécifique. Le terme « organisme vivant » lui-même fait également débat. Il ne fait aucun doute que les probiotiques suscitent beaucoup d’intérêt. Le moteur de recherche médical PubMed recense à lui seul 35 580 articles sur les lactobacilles et 8 300 articles sur les Lactobacilli comme probiotiques.

Bactéries vivantes

Les critiques soulignent que les bactéries ne vivent pas longtemps. La question est de savoir si les bactéries probiotiques mortes peuvent encore avoir un effet. Un autre point est de savoir si ces bactéries atteignent l’intestin vivantes. Une étude en double aveugle menée auprès de 114 jeunes volontaires en bonne santé ayant bu du yaourt contenant beaucoup de Lactobacillus delbrueckii a montré que les bactéries étaient presque introuvables dans l’intestin, car elles survivent mal à l’action de l’acide gastrique et de la bile. Les chercheurs ont conclu que ces bactéries ajoutées au lait ne méritaient pas le terme de probiotiques1.

Fonction des micro-organismes

Les micro-organismes n’ont toutefois pas besoin d’être vivants pour avoir un effet12 ; les lactobacilles morts ont eux aussi un effet bénéfique sur l’organisme. Des lactobacilles tués par rayonnement UV ont pu inhiber des messagers pro-infectieux (cytokines) favorisant une infection de l’intestin2.

Familles bactériennes de la flore intestinale

La microflore intestinale comprend plus de 500 familles bactériennes. Un groupe de scientifiques de Stanford a étudié 13 355 fragments d’ADN de bactéries présentes dans les selles et la muqueuse intestinale. La plupart correspondaient à des bactéries impossibles à cultiver et à des micro-organismes qui n’avaient encore jamais été mis en évidence. Certaines bactéries tolèrent l’oxygène, tandis que la majorité ne se développe que dans un environnement sans oxygène.

1. Bactéries aérobies, vivant avec de l’oxygène

Parmi les bactéries aérobies, les Enterobacteriaceae, les entérocoques et Lactobacillus spp. peuvent être mis en évidence par culture ; dans des conditions normales, ils représentent moins de 0,1 % de la flore.
La famille des Enterobacteriaceae se compose de différents types de bacilles à Gram négatif. Le groupe le plus important est formé par Escherichia coli bénéfique, qui joue un rôle important dans la stimulation du système immunitaire.
Les lactobacilles sont des bactéries productrices d’acide.
Les lactobacilles sont présents dans les cornichons, la choucroute11 et les olives ; une partie des lactobacilles intestinaux peut provenir de l’alimentation. En revanche, les lactobacilles constituent la population principale dans l’estomac et l’intestin grêle.
Les entérocoques appartiennent au groupe des streptocoques et sont présents dans le sol, l’eau et l’intestin. Ils sont bénéfiques pour l’intestin, produisent des antibiotiques naturels, inhibent les infections à Salmonella et maintiennent les cellules immunitaires en alerte.

2. Bactéries anaérobies, vivant sans oxygène

Environ 80 % d’une flore intestinale saine est constituée de deux embranchements différents, les Bacteroidetes et les espèces de Firmicutes. Ces bactéries ne tolèrent pas l’oxygène et meurent rapidement hors de l’organisme. Elles ne peuvent être identifiées qu’au moyen d’analyses ADN.

Différents types de probiotiques

L’administration de cultures bactériennes spécifiques, les probiotiques, peut restaurer partiellement la flore intestinale et être utilisée comme traitement. Certaines bactéries probiotiques spécifiques peuvent avoir un effet anti-inflammatoire8. L’utilisation de probiotiques en élevage réduit les maladies et s’accompagne d’une diminution de la mortalité due à la diarrhée9. Les probiotiques peuvent contenir différents types de bactéries :

1. Les suspensions d’E. coli ont un effet stimulant sur le système immunitaire et réduisent la réaction inflammatoire de la muqueuse
2. Lactobacilles. Il est intéressant de constater que l’administration de lactobacilles augmente le nombre d’E. coli, car ceux-ci bénéficient de la propriété acidifiante des lactobacilles.

• Lactobacillus acidophilus
• Lactobacillus brevis, isolé de plantes17
• Lactobacillus casei, paracasei KW3110
• Lactobacillus salivarus
• Lactobacillus delbrueckii, bulgaricus et salivarius
• Lactobacillus rhamnosus Gorbach & Goldin16, LGG. Cette bactérie a reçu le nom de ses « découvreurs » : Gorbach et Goldin.

1. Les bifidobactéries telles que Bifidobacterium breve et longum ont un effet modéré sur le système immunitaire ; l’administration en combinaison avec des lactobacilles est plus efficace.
2. Enterococcus faecalis. L’administration de probiotiques stimule de façon limitée le système immunitaire mais n’a pas d’effet sur les cellules T auxiliaires. Ils favorisent toutefois la fonction de la muqueuse et inhibent les organismes pathogènes.
3. Saccharomyces boulardii, une levure18. Des taux plus élevés d’immunoglobuline A dans l’intestin ont été observés lors de l’utilisation de la levure S. boulardii, ainsi qu’une augmentation d’IL-10. Ces levures sont plus efficaces que B. animalis et L. casei.

Marqueurs inflammatoires de la flore intestinale

De nombreuses personnes présentent une microflore anormale. Cela peut se manifester par un manque de bactéries bénéfiques, mais aussi par une prolifération d’espèces nocives ou une augmentation des marqueurs inflammatoires dans la flore intestinale. Les bactéries nocives peuvent stimuler les macrophages par l’intermédiaire de leur membrane cellulaire. Ces cellules immunitaires produisent des messagers, les cytokines, qui activent les globules blancs et les lymphocytes T. Les probiotiques régulent la réponse des cellules T auxiliaires des lymphocytes dans l’intestin19.

Les lymphocytes T auxiliaires de type 1 réagissent aux virus, aux bactéries et à la plupart des parasites intestinaux unicellulaires. Une réponse excessive peut entraîner des maladies auto-immunes. Une réaction Th1 trop forte peut provoquer des troubles inflammatoires chroniques, tels que des affections rhumatismales et la maladie de Crohn.
Les lymphocytes T auxiliaires de type 2 réagissent aux vers et au parasite Giardia lamblia. Les cellules Th2 produisent des messagers qui freinent les réactions inflammatoires et favorisent la croissance et la réparation. Une augmentation excessive de Th2 peut entraîner des allergies. Une faiblesse de Th1 peut provoquer une réaction Th2 exagérée, entraînant des réactions allergiques, de l’eczéma et des troubles intestinaux.

Espèces de Lactobacillus

Les espèces de Lactobacillus sont souvent utilisées comme probiotiques. Les études montrent que les différentes espèces ont des propriétés différentes :

• Lactobacilles capables d’inhiber les bactéries nocives : leur administration réduit le nombre de bactéries nocives5.
• L’administration de lactobacilles inhibe la croissance du parasite de l’intestin grêle Giardia lamblia ; ils peuvent donc être utilisés comme cure en cas d’infection.
• Les lactobacilles stimulent la formation d’immunoglobuline3 et peuvent contribuer à renforcer les défenses
• Lactobacillus plantarum et L. paracasei inhibent les réactions inflammatoires.
• Lactobacillus rhamnosus GG, LGG

Probiotique LGG

LGG est un probiotique d’origine humaine cultivé en laboratoire. Il ne provient donc pas de vaches et n’est pas cultivé sur un milieu contenant du lait. Un grand nombre d’études montrent que LGG

1. inhibe la réponse inflammatoire de l’intestin en réduisant le taux de messagers pro-infectieux ;
2. réduit les infections de la vessie16 ;

a toutefois un effet thérapeutique modeste chez les patients atteints de rectocolite hémorragique3,4, mais ne peut pas prévenir les inflammations intestinales.

Flore intestinale : antibiotiques et allergie

Une raison importante d’utiliser une préparation pour la flore intestinale14 est de favoriser la restauration de la flore après l’utilisation d’antibiotiques.

• Les antibiotiques entraînent une diminution de la flore intestinale saine.

Les antibiotiques perturbent le système immunitaire et provoquent un déplacement des cellules T auxiliaires de type 1 vers le type 2, ce qui peut entraîner des allergies, surtout chez les enfants. Lorsque la flore intestinale est restaurée immédiatement après l’utilisation d’antibiotiques, l’équilibre entre T auxiliaires 1 et 2 est maintenu15.

Prébiotiques et flore intestinale

Un prébiotique est une substance qui stimule la croissance des bactéries intestinales bénéfiques. Toutes les fibres végétales sont en fait des probiotiques, car elles favorisent la croissance. La consommation de légumes, d’algues et d’agar stimule la croissance. Ce sont de bons milieux nutritifs pour les lactobacilles et les bifidobactéries. Les topinambours et l’inuline contiennent des fructo-oligosaccharides ; ces sucres favorisent la croissance de la flore, mais provoquent souvent des flatulences.

Conseils en cas de troubles intestinaux

Si vous souffrez de troubles intestinaux, vous pouvez envisager l’un des conseils suivants :

1. Analyse de la flore intestinale. Il est recommandé aux personnes souffrant de troubles intestinaux de faire effectuer une analyse des selles : à la fois un examen parasitologique et une analyse de la flore intestinale. En cas de diminution de certaines espèces de bactéries intestinales, un probiotique peut être envisagé.
2. Les selles peuvent être analysées pour rechercher des facteurs inflammatoires tels que la calprotectine, la lactoferrine, la bêta-défensine et le TNF-alpha.
3. Les changements alimentaires sont essentiels pour calmer l’intestin.
4. L’inuline est parfois prescrite comme produit, mais elle provoque des flatulences. Il est préférable d’utiliser du bouillon, des légumes, des algues et de bonnes herbes et épices.

Références

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